Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf3Q9ET30 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms