Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm7Q9ESD6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms