Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ush1cQ9ES64 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms