Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trhr2Q9ERT2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trhr2Q9ERT2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms