Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hipk3Q9ERH7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hipk3Q9ERH7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms