Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb3Q9ERD7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms