Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slco1c1Q9ERB5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms