Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER62

Tnfrsf22, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 22, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf22Q9ER62 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf22Q9ER62 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms