Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms