Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndst3Q9EQH7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms