Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms