Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SgshQ9EQ08 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms