Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms