Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl4Q9DCU6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms