Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnft1Q9DCN7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft1Q9DCN7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms