Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms