Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp27a1Q9DBG1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms