Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Smg9Q9DB90 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Smg9Q9DB90 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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