Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pop5Q9DB28 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pop5Q9DB28 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms