Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rsph3bQ9DA80 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph3bQ9DA80 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms