Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA48

Spaca1, Sperm acrosome membrane-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spaca1Q9DA48 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spaca1Q9DA48 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms