Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms