Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tbc1d20Q9D9I4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tbc1d20Q9D9I4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tbc1d20Q9D9I4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tbc1d20Q9D9I4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d20Q9D9I4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tbc1d20Q9D9I4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms