Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D979 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D979 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Q9D979 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D979 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms