Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SlirpQ9D8T7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms