Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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