Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms