Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms