Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms