Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb4aQ9D6F9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms