Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms