Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rab11fip1Q9D620 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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