Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930513O06RikQ9D549 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930513O06RikQ9D549 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms