Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms