Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Phf6Q9D4J7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf6Q9D4J7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms