Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf3Q9D4H7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms