Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh2Q9D489 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms