Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms