Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pus10Q9D3U0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pus10Q9D3U0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms