Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3D0

Ttpal, Alpha-tocopherol transfer protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpalQ9D3D0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TtpalQ9D3D0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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TtpalQ9D3D0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtpalQ9D3D0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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TtpalQ9D3D0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms