Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms