Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms