Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chchd2Q9D1L0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chchd2Q9D1L0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chchd2Q9D1L0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chchd2Q9D1L0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chchd2Q9D1L0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms