Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1F3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms