Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms