Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps28Q9D1C8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps28Q9D1C8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms