Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Mrpl28Q9D1B9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Mrpl28Q9D1B9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl28Q9D1B9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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