Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm12Q9D0R8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lsm12Q9D0R8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms