Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbed3Q9D0L1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms