Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc80Q9D0F1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ndc80Q9D0F1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc80Q9D0F1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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